分子探针在什么情况下对探针有要求?
作者:king发布时间:2023-08-04分类:日常百科浏览:51
导读:今天哈哈社小编给各位讲解下探针变性方法的意思,也会对分子探针在什么情况下对探针有要求?(探针的种类及其优缺点)进行解释,如果能碰巧解决你现在面临的问题,别忘了关注本站,现在我们开始...
今天哈哈社小编给各位讲解下探针变性方法的意思,也会对分子探针在什么情况下对探针有要求?(探针的种类及其优缺点)进行解释,如果能碰巧解决你现在面临的问题,别忘了关注本站,现在我们开始吧! 分子探针在什么情况下对探针有要求?以分子杂交为基础的技术均用探针来检测具有互补序列的核酸序列。探针既可以是克隆的或PCR扩增的DNA分子,也可以是人工合成的寡聚核苷酸或经体外转录的RNA分子。探针必须是纯一的,不含有其他不同的核酸。为了保证通过碱基互补来检测目的基因,探针必须为单链分子。所以双链的DNA探针在应用前必须变为单链,一般采用加热的方法使双链DNA探针变性,原为单链的寡聚核苷酸和RNA探针的RNA分子无需变性处理即可使用。用放射性同位素标记探针,则杂交分子可通过放射自显影技术进行观测。近代,人们发展了非放射性同位素标记系统,常用的探针标记系统是用甾类化合物地高辛配基标记探针。什么是荧光分子探针荧光探针是建立在光谱化学和光学波导与测量技术基础上,选择性的将分析对象的化学信息连续转变为分析仪器易测量的荧光信号的分子测量装置。
荧光探针受到周围环境的影响,使其发生荧光发射发生变化,从而使人们获知周围环境的特征或者环境中存在的某种特定信息
灵敏度高,选择性好,使用方便,成本低,不需预处理,不受外界电磁场影响,远距离发光.
识别基团决定了探针分子的选择性和特异性,报告基团则决定了识别的灵敏度,而连接体部分则可起到分子识别枢纽的作用。什么是基因探针,用途是什么基因探针是什么?基因探针(probe)又称“寡核苷酸探针”,简称“探针”,就是一段与目的基因或DNA互补的特异核苷酸序列,它可以包括整个基因,也可以仅仅是/基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之转录而来的RNA。
1.探针的来源 DNA探针根据其来源有3种:一种来自基因组中有关的基因本身,称为基因组探针(genomic probe);另一种是从相应的基因转录获得了mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNa 探针(cDNa probe)。与基因组探针不同的是,cDNA探针不含有内含子序列。此外,还可在体外人工合成碱基数不多的与基因序列互补的DNA片段,称为寡核苷酸探针。
2.探针的制备 进行分子突变需要大量的探针拷贝,后者一般是通过分子克隆(molecular cloning)获得的。克隆是指用无性繁殖方法获得同一个体、细胞或分子的大量复制品。当制备基因组DNA探针进,应先制备基因组文库,即把基因组DNA打断,或用限制性酶作不完全水解,得到许多大小不等的随机片段,将这些片段体外重组到运载体(噬菌体、质粒等)中去,再将后者转染适当的宿主细胞如大肠肝菌,这时在固体培养基上可以得到许多携带有不同DNA片段的克隆噬菌斑,通过原位杂交,从中可筛出含有目的基因片段的克隆,然后通过细胞扩增,制备出大量的探针。
为了制备cDNA 探针,首先需分离纯化相应mRNA,这从含有大量mRNA的组织、细胞中比较容易做到,如从造血细胞中制备α或β珠蛋白mRNA。有了mRNA作模板后,在逆转录酶的作用下,就可以合成与之互补的DNA(即cDNA),cDNA与待测基因的编码区有完全相同的碱基顺序,但内含子已在加工过程中切除。
寡核苷酸探针是人工合成的,与已知基因DNA互补的,长度可从十几到几十个核苷酸的片段。如仅知蛋白质的氨基酸顺序量,也可以按氨基酸的密码推导出核苷酸序列,并用化学方法合成。
3.探针的标记 为了确定探针是否与相应的基因组DNA杂交,有必要对探针加以标记,以便在结合部位获得可识别的信号,通常采用放射性同位素32P标记探针的某种核苷酸α磷酸基。但近年来已发展了一些用非同位素如生物素、地高辛配体等作为标记物的方法。但都不及同位素敏感。非同位素标记的优点是保存时间较长,而且避免了同位素的污染。最常用的探针标记法是缺口平移法(nick translation)。首先用适当浓度的DNA酶Ⅰ(DNAseⅠ)在探针DNA双链上造成缺口,然后再借助于DNA聚合酶Ⅰ(DNa poly merasⅠ)的5’→3’的外切酶活性,切去带有5’磷酸的核苷酸;同时又利用该酶的5’→3’聚酶活性,使32P标记的互补核苷酸补入缺口,DNA聚合酶Ⅰ的这两种活性的交替作用,使缺口不断向3’的方向移动,同时DNA链上的核苷酸不断为32P标记的核苷酸所取代。
探针的标记也可以采用随机引物法,即向变性的探针溶液加入6个核苷酸的随机DNA小片段,作为引物,当后者与单链DNA互补结合后,按碱基互补原则不断在其3’OH端添加同位素标记的单核苷酸,这样也可以获得比放射性很高的DNA探针。dna点突变常用的检测方法有哪些基因突变检测方法:
(1) PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象,一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构,这种二级结构依赖于其碱基组成,即使一个碱基的不同,也会形成不同的二级结构而出刺同的迁移率。由于该法简单快速,因而被广泛用于未知基因突变的检测。
(2)异源双链分析法(HA) HA法直接在变性凝胶上分离杂交的突变型一野生型DNA双链。由于突变和野生型DNA形成的异源杂合双链DNA在其错配处会形成一突起,在非变性凝胶中电泳时,会产生与相应的同源双DNA不同的迁移率。该法与SSCP相似,所不同的是SSCP分离的是单链DNA,HA法分离的是双链DNA,也只适合于小片段的分析。
(3)突变体富集PCR法(mutant-enriched PCR)本法的基本原理是利用ras基因家族某个密码子部位存在已知的限制性内切酶位点,如K-ras基因第12密码子的BstNI位点,第13密古巴子有BgⅠⅡ位点。用链续二次的巢式PCR来扩增包括K-ras第12、13密码子的DNA片段,在两次扩增反应之间用相应的内切酶消化扩增的DNA片段,野生型因被酶切而不能进入第二次PCR扩增,而突变型则能完整进入第二次PCR扩增并得到产物的富集。DNA探针的工作原理dna杂交原理。探针是所要检测的目标dna的配对单链,送入体内后,若体内有所要检测的dna片段,探针dna就会和它结合配对,然后再用荧光检测基因探针的原理和本质是什么?纯化方式dsl和page的区别根据纯化方式的不同, DNA 制品可分为三个级别: OPC 级、 PAGE 级、高纯度级。OPC 级制品 : 进行 OPC 纯化,纯度大于 95% 。适用于 PCR 用引物、 DNA 测序用引物、各种探针等。此级别只接受 30mer 以下的制品。PAGE 级制品 : 用 PAGE 胶纯化,纯度大于 95% 。适用于 PCR 用引物、 DNA 测序用引物、各种探针等。纯化 30mer 以上的合成DNA 制品时,纯度高于 OPC 纯化法。高纯度级制品 : 采用高效液相色谱( HPLC )法进行纯化,纯度大于 99% 。由于纯度极高,使用本法纯化的 DNA 制品可适合于各种基因工程(Genetic Engineering)(Genetic Engineering)(Genetic Engineering)(Genetic Engineering)实验。特别是: PCR 克隆、定点突变、人工合成基因等。DNA探针的作用是什么? (高三基因工程) DNA分子杂交技术又是什么?在哪里用到?DNA探针的作用是用DNA探针进行的杂交试验。将未配对结合的探针洗去后,可用放射自显影或酶联反应等检测系统检测杂交反应中单个碱基突变和单个碱基的错配。DNA分子杂交技术是一种对基因工程中基因是否进入受体细胞的检测技术。有别于分子杂交技术,DNA分子杂交技术是针对于DNA而言,分子杂交技术针对对象可以是DNA也可以是RNA。DNA分子杂交技术在分子生物学领域中已广泛地使用于克隆基因的筛选、酶切图谱的制作、基因组中特定基因序列的定性、定量检测和疾病的诊断等方面。扩展资料:基因组DNA探针的获得有赖于分子克隆技术的发展和应用。要得到一种特异性DNA探针,常常是比较烦琐的。以细菌为例,细菌的基因组大小约为5×106碱基,约含3000个基因。要获得某细菌特异的核酸探针,通常要采取建立细菌基因组DNA文库的办法。即将细菌DNA切成小片段后(如用限制性内切酶做不完全水解)分别克隆得到包含基因组的全信息的克隆库,然后用多种其他菌种的DNA探针来筛选,产生杂交信号的克隆被剔除,最后剩下的不与任何其他细菌杂交的克隆则可能含有该细菌特异性DNA片段。参考资料来源:百度百科——DNA探针百度百科—— DNA分子杂交技术哈哈社推荐内容:茶叶和咖啡能一起喝吗?2013年湖南省委书记是谁飞机为什么会拉白线寓意天弘基金有限公司里面买那个产品好吗化学实验室 金属钠 钾 放哪里 白磷呢?溴呢?碘呢?宁波高新区属于什么区?这八字为七杀格,杀印相生,命主能否仕途亨通?吞咽困难怎么缓解?QQ空间留言板寄语事业单位公开招聘属于编制内么案例教学法中培训案例是如何编写与设计的立春吃春饼
荧光探针受到周围环境的影响,使其发生荧光发射发生变化,从而使人们获知周围环境的特征或者环境中存在的某种特定信息
灵敏度高,选择性好,使用方便,成本低,不需预处理,不受外界电磁场影响,远距离发光.
识别基团决定了探针分子的选择性和特异性,报告基团则决定了识别的灵敏度,而连接体部分则可起到分子识别枢纽的作用。什么是基因探针,用途是什么基因探针是什么?基因探针(probe)又称“寡核苷酸探针”,简称“探针”,就是一段与目的基因或DNA互补的特异核苷酸序列,它可以包括整个基因,也可以仅仅是/基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之转录而来的RNA。
1.探针的来源 DNA探针根据其来源有3种:一种来自基因组中有关的基因本身,称为基因组探针(genomic probe);另一种是从相应的基因转录获得了mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNa 探针(cDNa probe)。与基因组探针不同的是,cDNA探针不含有内含子序列。此外,还可在体外人工合成碱基数不多的与基因序列互补的DNA片段,称为寡核苷酸探针。
2.探针的制备 进行分子突变需要大量的探针拷贝,后者一般是通过分子克隆(molecular cloning)获得的。克隆是指用无性繁殖方法获得同一个体、细胞或分子的大量复制品。当制备基因组DNA探针进,应先制备基因组文库,即把基因组DNA打断,或用限制性酶作不完全水解,得到许多大小不等的随机片段,将这些片段体外重组到运载体(噬菌体、质粒等)中去,再将后者转染适当的宿主细胞如大肠肝菌,这时在固体培养基上可以得到许多携带有不同DNA片段的克隆噬菌斑,通过原位杂交,从中可筛出含有目的基因片段的克隆,然后通过细胞扩增,制备出大量的探针。
为了制备cDNA 探针,首先需分离纯化相应mRNA,这从含有大量mRNA的组织、细胞中比较容易做到,如从造血细胞中制备α或β珠蛋白mRNA。有了mRNA作模板后,在逆转录酶的作用下,就可以合成与之互补的DNA(即cDNA),cDNA与待测基因的编码区有完全相同的碱基顺序,但内含子已在加工过程中切除。
寡核苷酸探针是人工合成的,与已知基因DNA互补的,长度可从十几到几十个核苷酸的片段。如仅知蛋白质的氨基酸顺序量,也可以按氨基酸的密码推导出核苷酸序列,并用化学方法合成。
3.探针的标记 为了确定探针是否与相应的基因组DNA杂交,有必要对探针加以标记,以便在结合部位获得可识别的信号,通常采用放射性同位素32P标记探针的某种核苷酸α磷酸基。但近年来已发展了一些用非同位素如生物素、地高辛配体等作为标记物的方法。但都不及同位素敏感。非同位素标记的优点是保存时间较长,而且避免了同位素的污染。最常用的探针标记法是缺口平移法(nick translation)。首先用适当浓度的DNA酶Ⅰ(DNAseⅠ)在探针DNA双链上造成缺口,然后再借助于DNA聚合酶Ⅰ(DNa poly merasⅠ)的5’→3’的外切酶活性,切去带有5’磷酸的核苷酸;同时又利用该酶的5’→3’聚酶活性,使32P标记的互补核苷酸补入缺口,DNA聚合酶Ⅰ的这两种活性的交替作用,使缺口不断向3’的方向移动,同时DNA链上的核苷酸不断为32P标记的核苷酸所取代。
探针的标记也可以采用随机引物法,即向变性的探针溶液加入6个核苷酸的随机DNA小片段,作为引物,当后者与单链DNA互补结合后,按碱基互补原则不断在其3’OH端添加同位素标记的单核苷酸,这样也可以获得比放射性很高的DNA探针。dna点突变常用的检测方法有哪些基因突变检测方法:
(1) PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象,一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构,这种二级结构依赖于其碱基组成,即使一个碱基的不同,也会形成不同的二级结构而出刺同的迁移率。由于该法简单快速,因而被广泛用于未知基因突变的检测。
(2)异源双链分析法(HA) HA法直接在变性凝胶上分离杂交的突变型一野生型DNA双链。由于突变和野生型DNA形成的异源杂合双链DNA在其错配处会形成一突起,在非变性凝胶中电泳时,会产生与相应的同源双DNA不同的迁移率。该法与SSCP相似,所不同的是SSCP分离的是单链DNA,HA法分离的是双链DNA,也只适合于小片段的分析。
(3)突变体富集PCR法(mutant-enriched PCR)本法的基本原理是利用ras基因家族某个密码子部位存在已知的限制性内切酶位点,如K-ras基因第12密码子的BstNI位点,第13密古巴子有BgⅠⅡ位点。用链续二次的巢式PCR来扩增包括K-ras第12、13密码子的DNA片段,在两次扩增反应之间用相应的内切酶消化扩增的DNA片段,野生型因被酶切而不能进入第二次PCR扩增,而突变型则能完整进入第二次PCR扩增并得到产物的富集。DNA探针的工作原理dna杂交原理。探针是所要检测的目标dna的配对单链,送入体内后,若体内有所要检测的dna片段,探针dna就会和它结合配对,然后再用荧光检测基因探针的原理和本质是什么?纯化方式dsl和page的区别根据纯化方式的不同, DNA 制品可分为三个级别: OPC 级、 PAGE 级、高纯度级。OPC 级制品 : 进行 OPC 纯化,纯度大于 95% 。适用于 PCR 用引物、 DNA 测序用引物、各种探针等。此级别只接受 30mer 以下的制品。PAGE 级制品 : 用 PAGE 胶纯化,纯度大于 95% 。适用于 PCR 用引物、 DNA 测序用引物、各种探针等。纯化 30mer 以上的合成DNA 制品时,纯度高于 OPC 纯化法。高纯度级制品 : 采用高效液相色谱( HPLC )法进行纯化,纯度大于 99% 。由于纯度极高,使用本法纯化的 DNA 制品可适合于各种基因工程(Genetic Engineering)(Genetic Engineering)(Genetic Engineering)(Genetic Engineering)实验。特别是: PCR 克隆、定点突变、人工合成基因等。DNA探针的作用是什么? (高三基因工程) DNA分子杂交技术又是什么?在哪里用到?DNA探针的作用是用DNA探针进行的杂交试验。将未配对结合的探针洗去后,可用放射自显影或酶联反应等检测系统检测杂交反应中单个碱基突变和单个碱基的错配。DNA分子杂交技术是一种对基因工程中基因是否进入受体细胞的检测技术。有别于分子杂交技术,DNA分子杂交技术是针对于DNA而言,分子杂交技术针对对象可以是DNA也可以是RNA。DNA分子杂交技术在分子生物学领域中已广泛地使用于克隆基因的筛选、酶切图谱的制作、基因组中特定基因序列的定性、定量检测和疾病的诊断等方面。扩展资料:基因组DNA探针的获得有赖于分子克隆技术的发展和应用。要得到一种特异性DNA探针,常常是比较烦琐的。以细菌为例,细菌的基因组大小约为5×106碱基,约含3000个基因。要获得某细菌特异的核酸探针,通常要采取建立细菌基因组DNA文库的办法。即将细菌DNA切成小片段后(如用限制性内切酶做不完全水解)分别克隆得到包含基因组的全信息的克隆库,然后用多种其他菌种的DNA探针来筛选,产生杂交信号的克隆被剔除,最后剩下的不与任何其他细菌杂交的克隆则可能含有该细菌特异性DNA片段。参考资料来源:百度百科——DNA探针百度百科—— DNA分子杂交技术哈哈社推荐内容:茶叶和咖啡能一起喝吗?2013年湖南省委书记是谁飞机为什么会拉白线寓意天弘基金有限公司里面买那个产品好吗化学实验室 金属钠 钾 放哪里 白磷呢?溴呢?碘呢?宁波高新区属于什么区?这八字为七杀格,杀印相生,命主能否仕途亨通?吞咽困难怎么缓解?QQ空间留言板寄语事业单位公开招聘属于编制内么案例教学法中培训案例是如何编写与设计的立春吃春饼
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